Euroopa Komisjon alustas riigiabi uurimist 2013. aastal, et hinnata, kas riiklikud toetusmeetmed on Euroopa riigiabi reeglitega kooskõlas. Nimelt näevad Euroopa suunised ette, et raskustes olevale ettevõttele võib anda päästmisabi ainult üks kord kümne aasta jooksul, vastavalt nn ühekordse abi põhimõttele.

Estonian Airile oli selleks ajaks tehtud juba kolm kapitalisüsti: 2009. aastal 7,3 miljonit eurot, 2010. aastal 19,9 miljonit eurot ja aastatel 2011–2012 veel 30 miljonit eurot. Komisjoni sellest ei teavitatud. Hiljem andis valitsus veel Estonian Airile päästmisabilaenuna u 40 miljonit eurot.