Praegu maksustatakse toetusi füüsiliste isikute puhul ainult siis, kui saaja on füüsilisest isikust ettevõtja. Selline olukord põhjustab rahandusministeeriumi hinnangul turumoonutusi, millele on juhtinud tähelepanu ka Eesti põllumajandus-kaubanduskoda.

Põllumajandustoetuste laiem maksustamine on ministeeriumi hinnangul põhjendatud, sest nende maksmisega hüvitatakse põllumajandustootjatel või erametsaomanikel saamata jäävat tulu, kompenseeritakse muul moel turutõrkeid või makstakse toetust mingi tegevuse jaoks.